Hiện nay, trường có hệ thống cơ sở vật chất khá đầy đủ. Các dãy phòng học khang trang, sạch đẹp cùng các phòng bộ môn, phòng chức năng được trang bị đầy đủ trang thiết bị, các dụng cụ dạy học. Ngoài ra, trường còn đầu tư xây dựng các sân chơi, bãi tập cho các em học sinh vui chơi, rèn luyện thể dục thể thao. Trong suốt quá trình hình thành và phát triển, thầy và trò Trường THPT Phan Bội Châu vẫn luôn coi việc nâng cao chất lượng dạy và học, tạo môi trường học tập lành mạnh là ưu tiên hàng đầu. Vì thế, trường đã đạt được nhiều thành tích xuất sắc. Bên cạnh đó, các hoạt động ngoại khóa như thi văn nghệ, thể thao hay các hoạt động tình nguyện cũng được nhà trường quan tâm tổ chức nhằm tạo sân chơi lành mạnh cho học sinh phát huy khả năng của mình. Chất lượng đội ngũ giáo viên cũng ngày càng được nâng cao. Thể hiện rõ trong việc nhà trường xây dựng thành công trường THPT đạt chuẩn quốc gia mức độ 1. Có nhiều giáo viên dạy giỏi cấp tỉnh. Hàng năm tỷ lệ học sinh xếp loại hạnh kiểm khá và tốt trên 99%; tỷ lệ học lực từ khá trở lên đạt 94.31%; tỷ lệ học sinh tốt nghiệp THPT trên 99%; bình quân 70% học sinh trúng tuyển vào các trường đại học.
Tuy nhiên, cơ sở vật chất của trường do sử dụng lâu ngày một số công trình xuống cấp, hư hỏng ảnh hưởng đến chất lượng giáo dục. Trong đó, khối phòng học dãy A có 16 phòng được đầu tư xây dựng năm 1956; khối phòng học dãy B có 12 phòng (9 phòng học và 3 phòng học tận dụng làm phòng y tế, phòng quản lý tư vấn học sinh, phòng nghỉ của giáo viên) được đầu tư xây dựng năm 1996; khối phòng học dãy C có 24 phòng được đầu tư xây dựng năm 1998; phòng làm việc bộ phận hành chính, khối phòng thí nghiệm và truyền thống, khối thư viện cũ 2 tầng được xây dựng năm 1956; khối nhà làm việc 2 tầng của Ban Giám hiệu được xây dựng năm 1997; khối phòng thí nghiệm 4 tầng xây dựng năm 2011; khối nhà thư viện mới 2 tầng xây dựng năm 2022. Hiện một số hạng mục công trình đã xuống cấp như 3 khối phòng học A, B. Khối phòng Ban Giám hiệu đã xuống cấp, trần thấm dột, tường bong tróc; thư viện cũ đã xuống cấp, ẩm thấm…
Để bảo đảm chất lượng dạy và học của giáo viên, học sinh và trên cơ sở đề xuất của UBND TP. Phan Thiết, tháng 10/2023 HĐND tỉnh đã ban hành nghị quyết phê duyệt về chủ trương đầu tư dự án Trường THPT Phan Bội Châu với tổng mức đầu tư 44.650 triệu đồng từ nguồn vốn xổ số kiến thiết. Dự án có quy mô đầu tư gồm: Xây dựng mới khối hành chính quản trị và phòng bộ môn; khối nhà vệ sinh; cải tạo, sửa chữa các khối phòng học A, B, C; các hạng mục phụ trợ và đầu tư trang thiết bị cho công trình nhằm đảm bảo cơ sở vật chất, đáp ứng nhu cầu cho việc dạy và học của nhà trường. Hiện dự án được khởi động và dự kiến sẽ hoàn thành trong năm 2025.