Đồng thời, quán triệt, triển khai thực hiện đầy đủ, nghiêm túc những nội dung theo chỉ đạo của Bộ Nông nghiệp và PTNT, góp phần quản lý, giám sát chặt chẽ tàu cá hoạt động trên biển, chống khai thác IUU. Bên cạnh đó, phối hợp với các địa phương vùng biển tuyên truyền, vận động các chủ tàu cá chưa lắp đặt thiết bị VMS thực hiện lắp đặt theo quy định. Định kỳ hàng tháng rà soát, thống kê danh sách tàu cá chưa lắp đặt thiết bị (nêu rõ thông tin tàu cá, nguyên nhân chưa lắp đặt, vị trí tàu đang neo đậu... ). Đồng thời, thông báo đến các cơ quan, đơn vị chức năng (Biên phòng, Kiểm ngư, Văn phòng kiểm soát nghề cá) theo dõi, kiểm soát. Tiến hành rà soát các tàu cá bị chìm, cháy, mất tích, nước ngoài bắt giữ tịch thu... và có biện pháp xóa đăng ký theo quy định.
Chỉ đạo lực lượng của chi cục tại các Văn phòng đại diện kiểm soát nghề cá tại cảng cá phối hợp chặt chẽ với các lực lượng của Bộ đội Biên phòng tỉnh và Ban Quản lý các cảng cá tỉnh trong công tác kiểm tra, kiểm soát tàu cá ra vào cảng theo đúng quy định. Sử dụng hệ thống giám sát tàu cá để kiểm soát một cách hiệu quả việc tàu cá ra vào cảng; giám sát chặt chẽ việc niêm phong kẹp chì thiết bị trước khi tàu cá ra vào cảng; xử lý nghiêm khắc các trường hợp vi phạm.