Trong năm học 2021-2022, Trường THPT Dân tộc nội trú có 27 lớp với gần 900 học sinh là học sinh thiểu số, vì vậy việc trường thực hiện nghiêm các quy định về phòng dịch nhằm tạo môi trường học tập an toàn ổn định cho học sinh. Cùng với sự quan tâm chu đáo của nhà trường, gia đình và bản thân các em học sinh cũng đã chủ động mua sắm đủ các vật dụng như khẩu trang, nước rửa tay sát khuẩn và các đồ dùng cá nhân cần thiết. Tuy nhiên, dịch Covid-19 đang diễn biến phức tạp, nhà trường đã thực hiện nghiêm các biện pháp phòng dịch trong quá trình học sinh vào trường lưu trú trực tiếp sinh hoạt tại trường, hạn chế tối đa việc ra khỏi trường, cùng với việc tăng cường tuyên truyền nhắc nhở học sinh nghiêm túc thực hiện nguyên tắc 5K, hướng dẫn sát khuẩn tay, đồng thời thường xuyên tổ chức vệ sinh khử khuẩn khu vực lớp học, phòng ở, đo thân nhiệt cho giáo viên và học sinh trong trường.
Nhận thức rất rõ về dịch Covid-19 nên các em học sinh khi trở lại trường đều nêu cao ý thức, trách nhiệm trong việc giữ vệ sinh chung, khu ký túc xá ở được các em dọn dẹp sạch sẽ, gọn gàng. Các bảng hướng dẫn về phòng, chống dịch Covid-19 được đặt tại khu vực học sinh dễ thấy; ở từng lớp đều được trang bị nước rửa tay sát khuẩn… Sau khi tiến hành test nhanh khi học sinh trở lại trường, nhà trường đã tăng cường kiểm soát nhằm quản lý chặt chẽ, không để học sinh tiếp xúc với môi trường bên ngoài nhằm ngăn chặn nguồn lây từ bên ngoài vào trường.